代理纳税审查，不是行使税务机关纳税检查的职责，而是帮助纳税人进行纳税自查，也可以说是对纳税人缴纳税款情况进行审核，对少缴未缴税款，纳税人自行补缴，以避免受到税务机关的处罚；对于多缴税款，可代纳税人申请退税或者抵冲下期应交税款。代理纳税审查的事项有：

代办申请退税（包括代办外资企业出口退税手续、外资企业采购国产设备退、免税），是指税务代理人依照有关法律、行政法规的规定，帮助纳税人准备完整、充分的退税资料（对出口退税企业，则将退税单证录入计算机。以达到退税电子化管理的要求），使纳税人充分享受到国家给予的退税政策优惠。

1）增值税纳税审查；

2）消费税纳税审查；

3）营业税纳税审查；

4）企业所得税纳税审查（具体包括亏损额认定和所得税汇算清缴鉴证等）；

5）其他税种纳税审查。

经税务师事务所和执业注册税务师签章的涉税鉴证报告，税务机关可作为受理企业纳税申报、开展税务稽查的参考依据。